メインキャラ
海命凍矢：志武谷支部所属のイリーガルとしてUGNに協力している中学生。
闇代月：志武谷支部所属のUGNチルドレン。表向きは中学生として過ごしている。
七雲空：FH所属の何でも屋。二重人格で、裏の方は黒羽蒼空と言う。
御坂翼：FH所属のレネゲイドビーイングだが、実はゼノスのスパイ。かなりのオタク。


UGN所属
霧谷雄吾：UGN日本支部長を務める男性。根が良い人なだけに、多忙を務めている。
テレーズ・ブルム：UGN中枢評議員の一人。凍矢を助けてからも、手助けをしてくれる。

一章
羽狛早苗：UGN育成機関の志武谷支部の支部長。表は喫茶店のマスターをしている。
ネク：ヘッドフォンを付けた中学生の少年。UGNイリーガルとして協力している。
シキ：支部に所属している少女。ネクと同じくイリーガルとして登録されている。
ビイト：本名、尾藤大輔之丞。ネク達と同い年で同じクラス。UGNイリーガル。
ライム：本名、尾藤来夢。ビイトの妹であり、同じくUGNイリーガル。
ヨシュア：本名、桐生義弥。UGNチルドレンで、プレーンの役割を担っている。

三章
闇代陸：闇代グループの現社長で月の父親。UGNに資金や研究機関を提供している。
闇代汐音：陸の妻で、月の母。FHの策略により、実験体にされてしまい死亡した。

外伝
神影小暮：表向きは教師をしているUGNエージェント。敵味方も恐れる伝説級のド変態。
鶴月愛星：UGN黄昏支部の支部長。孤児院を経営しながらチルドレンを育てている。
言峰切嗣：UGNイリーガル。黄昏市で神父をしながら、養子の息子と共に生活している。


FH所属
春日恭二：ディアボロスの二つ名を持つFHエージェント。別名、ダブクロのアイドル。
黒須左京：マスターレイスの名を持つ少年。家族を失った悲しき過去を持っている。
アルフレッド・J・コードウェル：FHの幹部に匹敵する人物。雷神は彼の部下だった。

一章
狩谷：ブラックスカル団のセルリーダー。管理セルとして他のFHを手伝っている。
卯月：FHエージェント。実力は高く、主に戦闘部隊として他のセルに出張する。
南師：FHエージェント。非常に頭がキレるが、言語能力が独特過ぎる。
虚西：FHエージェント。主に南師と共にプレーンとして行動をしたりする。
777：人気バンドのボーカルを務めるFHエージェント。セル内の常識人でもある。
BJ：777と共にバンドを務めるFHエージェント。卯月に淡い恋心を抱いている。
テンホー：共にバンドをしているFHエージェント。一番の常識人と自負している。

外伝
神影雷神：教師をしているが、実はFHマーセナリー。過去に暗殺業をしていた。


その他
都築京香：ゼノスのリーダー。翼の上司であり、様々な“プラン”を巡らせている。
御剣祥耶：暴力団の組長。空とは警察時代からの知り合いで、今も交流がある。
猫川亜美：金にがめつい情報屋の少女。なんやかんやあって小暮と知り合った。

一章
エリー：翼の友達の小学生。一般人だが、レネゲイドについて知っている数少ない人物。

外伝
神影恋火：黄昏市の高校生。ある事件をきっかけにオーヴァードへと覚醒した。
狭川羽粋：神影家の隣に住む少女。【ダークカオス】と言うセルに狙われている。


FHダークカオス
ベル・シャーマン：元UGNイリーガルの外人。翼と月の手によって倒された。
天義星華：空の恋人であり同僚のUGNエージェント。最後は空によって殺された。
金符宴：中国出身のFHエージェント。傲慢な性格な所為で、仲間によって餌にされる。
風切冷牙：情報と変装に特化した、潜入工作員。闇代家の絆を感じながら最期を遂げた。
黒瀬闇一：FHチルドレン。狭川家の弟として潜入していたが、今はUGNに保護された。
氷置大湖：FHチルドレン。闇一の相棒であり、共にUGNの監視処分を受けている。